پس از تستهای بمب اتم کشور فرانسه در اقيانوس آرام، يک جانور ناشناخته کشف می شود که در حال حرکت بسمت کانال پاناما است. يک دانشمند به اسم نيکو برای بررسی اين موضوع فراخوانده می شود. او سرانجام در می يابد که اين موجود يک سوسمار عظيم الجثه به اسم گودزيلا است که در اثر تشعشعات راديو اکتيو ناشی از انفجار بمب اتمی به اين صورت در آمده است. گودزيلا سپس مسيرش را بطرف آمريکا تغيير می دهد. در حاليکه ارتش تلاش می کند تا با اين هيولا مبارزه کرده و اهالی نيويورک را از حمله وی نجات دهد نيکو نيز در تلاش برای يافتن اطلاعات بيشتری در مورد گودزيلا است. او هزاران تخم اين موجود را در زير نيويورک کشف می کند . گودزيلا خرابيهای فراوانی را در نيويورک به بار می آورد و دانشمندان و ارتش نيز می کوشند تا راهی برای نابود کردن او و فرزندانش پيدا کنند